コドン最適化
コドン最適化は、ターゲット遺伝子の遺伝コードを微調整し、タンパク質発現レベルや生物学的活性を向上させる最先端技術です。長年の業界経験を持つ遺伝子合成の専門家として、GenCefe Biotechはコドン最適化がユーザーの下流アプリケーションにおいて重要な役割を果たすことを十分に理解しています。当社では、コドン最適化に先進的な人工知能技術を導入し、独自に「コドン最適化ツール」を開発。より最適化されたアルゴリズムで、研究や応用をサポートします。
アドバンテージ
カスタムコドン最適化：宿主生物に合わせて遺伝子配列を最適化し、翻訳効率を向上させ、バイアスを最小化します。
タンパク質収量の最大化：需要の高いアプリケーション向けにタンパク質生産量を向上させます。
機能性の向上：リコンビナントタンパク質のフォールディング、安定性、活性を向上させます
マルチホスト対応：当社のサービスは細菌、酵母、植物、哺乳類細胞をカバーします。
事例紹介：大腸菌における真核タンパク質発現量が7.4倍に増加
目的：GenCefeのコドン最適化ツールで最適化した真核遺伝子の大腸菌における発現レベルを評価すること
メソッド：野生型SKN-1遺伝子を当社のコドン最適化ソフトウェアと手順で解析・最適化しました。最適化された遺伝子は、その後大腸菌発現ベクターにクローニングされました。この遺伝子を持つ細菌を培養し、タンパク質発現を誘導しました。比較対象として野生型遺伝子も使用しました。タンパク質発現はウェスタンブロットで確認しました。最適化遺伝子および野生型遺伝子それぞれ3つのクローンを解析し、結果は図1に示されています。
結果：最適化されたSKN-1遺伝子を含む3つのクローンは、それぞれ野生型クローンに比べて6倍、7.2倍、9倍の発現増加を示し、平均で7.4倍の増加となりました。
図1：左：野生型および最適化されたSKN-1遺伝子を発現する細菌溶解液のタンパク質電気泳動。右：ウェスタンブロットによるタンパク質定量。
